Además de actuar, Perrette también publica poesías, escribe, fotografía y es una artista de la palabra hablada, amante de la música y de todas las cosas, y una apasionada defensora de los derechos civiles. Fue la vocalista de la banda "Lo-Ball", de Los Ángeles; una canción de Lo-Ball se puede oír durante la película "Una rubia muy legal". Es también productora de documentales y en 2007 filmó un documental sobre el abogado y autor Mark Lane, sobre los derechos civiles de Estados Unidos. Perrete colabora con muchas organizaciones de caridad, incluido el rescate de animales, la Cruz Roja Americana, derechos civiles y derechos Gay. Estuvo casada durante 3 años con el músico "Coyote Shivers". Perrete ha concedido cuatro órdenes de restricción consecutivas contra Shivers. En un tour con cámaras de televisión por las oficinas del NCIS real en septiembre de 2005, el Director del Laboratorio Forense "Dawn Sorenson" (el alter ego en la realidad de Abby), le dijo a Perrette que "Haces que parezcamos todos buenos, te estamos realmente agradecidos". En febrero de 2007, Perrete eliminó su blog y su página web porque alguien no la dejaba en paz y seguía obsesivamente su blog en busca de información personal. Perrette dijo que estaba siendo atemorizada y que su seguridad estaba en riesgo. Curiosamente en un capítulo de la 3ª temporada le sucede algo similar en la serie, liga con un chico por internet algo chiflado que la persigue hasta dentro de las oficinas del NCIS.