Lynch trabajó muchos años en teatro, realizando giras con el grupo cómico The Second City representando el papel de Carol Brady en The Real Live Brady Bunch. Escribió y protagonizó la obra de teatro Oh Sister, My Sister (oh, hermana, mi hermana). Producido originalmente en 1998, esta obra ganó el programa Lesbians in Theater en el L.A. Gay & Lesbian Center (Centro Gay y Lésbico en Los Ángeles) en 2004. Realizó el papel de Christy Cummings, una cuidadora de perros lesbiana contratada por la esposa-trofeo Sheri Ann Cabot (protagonizado por Jennifer Coolidge en el mockumentary Best in Show (2000), del director Christopher Guest. También apareció en A Mighty Wind (2003) como una actriz porno convertida en la cantante folk Laurie Bohner y en For Your Consideration (2006) como reportera de entretenimiento. Lynch ha actuado también muchos años en televisión. Protagonizó con John Hannah y William Fichtnerel programa MDs (2002), y ha hecho apariciones como invitada en varias series de televisión. Actualmente pertenece al elenco de Glee. En 2005, Power Up nombró a Lynch como una de las «10 lesbianas más asombrosas en el negocio del espectáculo».